性交造成生殖器損傷的情況是較少見的，即使發生也多因生殖器存在潛在的異常。但話又說回來了，性傳播疾病的發生多與生殖器損傷有關，因為損傷才使病原微生物得以進入患者體內，當然這種損傷是輕微的，往往是肉眼難以發現的。我們這里談的可都是非常明顯的損傷。
1、尿道炎──激烈的性交往往使某些男子發生尿道炎，特別是患者具有包莖、個人衛生差、或女方有陰道炎時。尿道會有觸痛，有時有尿痛，通過顯微鏡檢查和培養可以作出診斷和鑒別其病因。
由于尿道海綿體在勃起時充血變硬，所以容易受到損傷。在陰莖根部使用負壓吸引裝置或理療環等性器具以增進或延長勃起時可能損傷尿道。事先早已存在的尿道炎、尿道結石、尿道憩室、尿道狹窄等異常均可增加尿道損傷的可能性。
2、陰莖皮膚創傷──常見于咬傷，潛在的包皮異常和使用性工具。尤其是器具的使用可使遠端出現水腫后往往難于或無法取下器具。除非拖延過久出現壞死，大多數可以完全恢復。有時因尿道水腫嚴重引起排尿困難，可能需要使用2號導尿管或行恥骨上膀胱造口術。
3、包皮嵌內──發生于包皮過長過緊的男子，當包皮后退到龜頭后的冠狀溝時，由于龜頭充血和包皮水腫，包皮無法回到原來位置。這時應限制對龜頭的血液供應，因此需要立即去醫院處理這一問題。
